Innerhalb einer reinen Projektorganisation entsprechen die Projekte den Organisationseinheiten. Dies bedeutet, dass die Projektleiter die volle Führungsverantwortung gegenüber den Mitgliedern des Projektteams haben. Ggf. gibt es innerhalb des Projekts eine eigene Personalhierarchie mit Teilprojektleitern und Gruppenleitern.

In einem Unternehmen mit reiner Projektorganisation ist von den Mitarbeitern eine höhere Flexibilität gefordert als bei Unternehmen mit Linienorganisation, da ihre Position in erster Linie von ihrem aktuellen Projekt abhängt. Ein Projektleiter kann nach Ablauf seines Projektes z.B. wieder "einfaches" Mitglied eines neuen Projektteams werden.